Po pierwsze sprawdz czy masz partycje na drugim dysku, którego windows nie widzi.
Niezależnie, czy jest to xp lub vista uruchom menu strat następnie kliknij w uruchom i wpisz compmgmt.msc Uruchomi się zarządzanie komputerem przejdz do zakładki mazgazyn>zarządzanie dyskami. Jeżlei na dysku nie ma partycji, będzie on oznaczony czarnym kolorem i napisem nie przydzielony.
Sprawdz też podłączenie dysku i płyty przez kabelek sata. Kabelkisata które są dodawne do płyty często lubią się poluzowyać. Dlatego polecam taki
http://www.allegro.pl/item657227327_tasma_sata_stabilne_polaczenie_western_digital_wd.html sam używam giętki, ekranowany, prawidłowo trzyma wtycznkę w dysku gratis kabelek i zworka.