Czysto teoretycznie wszystko zależy od wielkości przechowywanych na partycji danych.
Jeśli pliki są duże: filmy itp., to większy rozmiar klastra (jednostka alokacji) powoduje mniejszą fragmentację danych (mniej kawałków) i poprawia czas dostępu.
Jeśli jednak na tak sformatowanym dysku było by bardzo dużo małych plików: pliki tekstowe itp. to wtedy dużo miejsca na dysku będzie się marnowało. Dzieje się tak dlatego, że przy wybraniu np 32 KB jako rozmiaru klastra, będzie to najmniejszy rozmiar jaki może przybrać plik. Choćby miał 1 KB to na dysku zajmie 32, zatem 31 jest marnotrawionych.
Rozmiar klastra się zmieniał w przypadku formatowania partycji w FAT32 i uzależniony był od jej wielkości. NTFS dla każdego rozmiaru partycji ma standardowy rozmiar klastra 4 KB. Bezpiecznie można pozostawić tę wartość jako domyślną.
Natomiast formatowanie szybkie różni się od normalnego tym, że pomijane jest skanowanie dysku w poszukiwaniu bad blocków. Jeśli dysk jest całkowicie sprawny bezpiecznie można zrobić szybki format, oszczędzi to mnóstwa czasu potrzebnego na skan całego dysku. Jeśli są jakieś kłopoty z dyskiem to warto zrobić pełny format.