Musisz wskazac na ten obszar i zaznaczyc odpowiedni filesystem (ext-4 bylby najlepszy), wowczas Ubuntu bedzie mogl uzyc ta partycje jako swoja systemowa, przynajmniej to pamietam z instalacji Mandrivy, bo ja robilem dziesiatki razy, a Ubuntu tylko raz i jakos tak szybko zlecialo :-).
Masz cos takiego, jak ponizej ?
http://www.easy-ubuntu-linux.com/ubuntu-installation-606-9.html
Jak nie - daj fotki, moze jest tam cos, co trzeba zaznaczyc, a ja nie znam instalatora Ubuntu na pamiec, ale z wygladu mozna cos zawsze wykminic :)
Dobrze jest tez miec swapa, w zaleznosci od zuzycia pamieci w systemie bedzie to mniej lub wiecej, ale 2 GB standardowo dobrze na ten cel wygospodarowac.